Formål
Arvelige højrisiko mutationer i kræftgener er årsag til 15-20% af al børnekræft.
Et stort problem i den nuværende diagnostik er, at man hos over 40 % af de børn, hvor man finder en genforandring, ikke kan afgøre, om den faktisk er kræftfremkaldende eller blot en naturlig, ufarlig variation. Disse usikre genforandringer kaldes ”variants of uncertain significance” (VUS). For de mere end 40 % af børn med mistanke om arvelig kræft, hvor man finder en VUS, kan man derfor ikke stille en sikker genetisk diagnose.
Forskerne bag dette projekt har udviklet en metode kaldet CRISPR-Select, som kan afgøre, om bestemte genforandringer er kræftfremkaldende. Metoden har allerede vist lovende resultater og er nu i brug til voksne patienter på Rigshospitalet.
Men i børnekræftområdet er der brug for en langt hurtigere og mere effektiv løsning, fordi antallet af mutationer og gener, der skal undersøges, er meget stort. Derfor har forskerne modtaget støtte til at udvikle en høj-effektiv version af CRISPR-Select, der kan analysere hundredvis af mutationer på én gang.
Projektet kan bane vejen for et gennembrud i diagnostik, forebyggelse og behandling på tværs af alle former for arvelig børnekræft.
Status
Igangværende projekt.
Resultater
- Det er lykkedes forskergruppen at udvikle en højt avanceret og fuldautomatisk CRISPR-Select-analysepipeline med genet MLH1 som proof-of-principle. Denne teknologi gør det muligt at udføre CRISPR-Select-analyser med høj kapacitet og meget høj datakvalitet.
- Der er udviklet specialiserede softwareprogrammer, som understøtter de automatiserede analyser.
- Forskerne har etableret cellelinjer til CRISPR-Select-diagnostik for seks af projektets ti vigtigste børnekræftgener: MLH1, MSH2, TP53, ATM, DDX41 og APC.
- Forskerne har hermed opnået et stærkt fundament til at videreføre projektet.
Støtteår
- Støttet med 1.600.000 kr. i år 2023
- Støttet med 1.100.000 kr. i år 2024
Samarbejdspartnere
Projektet er finansieret i samarbejde med Knæk Cancer.